Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist1h3bP84228 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist1h3bP84228 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms