Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gabpb2P81069 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms