Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx3P81067 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx3P81067 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx3P81067 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms