Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx2P80206 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Otx2P80206 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otx2P80206 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx2P80206 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx2P80206 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms