Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx1P63013 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms