Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vsnl1P62761 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vsnl1P62761 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vsnl1P62761 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms