Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms