Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snrpd1P62315 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms