Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm3P62311 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm3P62311 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm3P62311 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm3P62311 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lsm3P62311 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm3P62311 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms