Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps13P62301 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps13P62301 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps13P62301 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms