Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan5P62080 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms