Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ActbP60710 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ActbP60710 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ActbP60710 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ActbP60710 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ActbP60710 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ActbP60710 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ActbP60710 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ActbP60710 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ActbP60710 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ActbP60710 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ActbP60710 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms