Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm6sf1P58749 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm6sf1P58749 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms