Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctdsp1P58466 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp1P58466 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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