Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpdl3bP58242 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpdl3bP58242 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms