Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpa1P57784 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms