Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn18P56857 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn18P56857 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn18P56857 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn18P56857 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Cldn18P56857 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms