Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace1P56818 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace1P56818 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace1P56818 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms