Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cox17P56394 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cox17P56394 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cox17P56394 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms