Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GemP55041 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GemP55041 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GemP55041 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GemP55041 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GemP55041 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GemP55041 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GemP55041 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GemP55041 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GemP55041 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GemP55041 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GemP55041 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GemP55041 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GemP55041 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GemP55041 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GemP55041 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GemP55041 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GemP55041 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GemP55041 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GemP55041 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GemP55041 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GemP55041 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GemP55041 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms