Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acod1P54987 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acod1P54987 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acod1P54987 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms