Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec1P51908 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms