Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa-rs7P50715 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs7P50715 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms