Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defa6P50704 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Defa6P50704 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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