Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TspoP50637 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TspoP50637 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TspoP50637 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TspoP50637 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TspoP50637 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TspoP50637 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TspoP50637 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TspoP50637 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TspoP50637 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TspoP50637 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TspoP50637 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TspoP50637 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TspoP50637 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TspoP50637 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TspoP50637 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TspoP50637 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TspoP50637 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TspoP50637 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TspoP50637 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TspoP50637 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TspoP50637 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TspoP50637 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TspoP50637 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TspoP50637 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TspoP50637 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TspoP50637 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TspoP50637 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TspoP50637 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TspoP50637 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TspoP50637 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TspoP50637 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TspoP50637 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TspoP50637 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms