Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FmodP50608 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FmodP50608 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FmodP50608 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FmodP50608 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FmodP50608 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FmodP50608 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FmodP50608 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FmodP50608 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FmodP50608 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FmodP50608 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FmodP50608 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FmodP50608 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FmodP50608 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FmodP50608 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FmodP50608 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FmodP50608 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FmodP50608 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FmodP50608 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FmodP50608 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FmodP50608 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FmodP50608 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FmodP50608 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FmodP50608 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FmodP50608 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FmodP50608 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FmodP50608 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms