Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
VegfbP49766 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfbP49766 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VegfbP49766 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VegfbP49766 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VegfbP49766 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms