Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna7P49582 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms