Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtpreP49446 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpreP49446 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms