Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb42P49222 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms