Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptx3P48759 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms