Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax9P47242 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax9P47242 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax9P47242 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax9P47242 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax9P47242 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms