Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf1P46099 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf1P46099 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms