Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hmx2P43687 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hmx2P43687 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms