Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Egr3P43300 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr3P43300 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms