Protein–RNA interactions for Protein: P43276

Hist1h1b, Histone H1.5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h1bP43276 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hist1h1bP43276 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist1h1bP43276 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms