Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdf5P43027 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms