Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox6a1P43024 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms