Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmx3P42581 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmx3P42581 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms