Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc19a1P41438 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc19a1P41438 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms