Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VhlP40338 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VhlP40338 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VhlP40338 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VhlP40338 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
VhlP40338 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VhlP40338 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VhlP40338 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms