Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col18a1P39061 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col18a1P39061 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col18a1P39061 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms