Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lig1P37913 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lig1P37913 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig1P37913 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig1P37913 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig1P37913 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig1P37913 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms