Protein–RNA interactions for Protein: P37237

Fgf8, Fibroblast growth factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf8P37237 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf8P37237 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf8P37237 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms