Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6fP35460 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6fP35460 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6fP35460 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6fP35460 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6fP35460 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6fP35460 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6fP35460 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms