Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes1P35428 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes1P35428 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hes1P35428 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms