Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mmp12P34960 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms