Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoc3P33622 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms