Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nedd1P33215 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms