Protein–RNA interactions for Protein: P32972

Tnfsf8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf8P32972 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf8P32972 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms